我们要及时发现问题的先决条件并保存好相应记录。如果设备的脱盐率及产水量发生下降时，应先校正设备的仪表，避免由于仪表原因而发生误判。仪表包括：电导率表、温度表、压力表、流量表等等。然后就是要对记录的数据进行标准化规整。如果由于温度、回收率、水通量、进水tds及使用寿命等发生的变化，将引起脱盐率与产水量的相应变化。我们要通过精准的计算来得到标准化产水量与脱盐率，再与初始运行数据相比较，这样来确认系统的故障。
在使用反渗透设备的过程中，难免会遇到一些问题，主要问题是设备脱盐率的下降，和产水量的降低，如果出现其中任何一个现象，原因极有可能是污垢杂质或者水垢所导致的。如果确定是这个问题，通过适当的清洗就可以解决了。如果设备突然快速的性能下降，就有可能是系统出现问题或操作不当造成的。出现了问题，要先保存好相应的记录，之后就要立刻解决，否则延误了时机会导致反渗透膜没有办法恢复到原来的状态。
对于反渗透系统，习惯地把进水分为地下水、自来水、地表水、海水、废水(中水)等，这些水体受各种因素的影响，不同的地理条件，不同的季节气候导致水体的特性及其所含的杂质有所不同，因此反渗透预处理工艺也会有所不同。合理地预处理应该能满足如下要求：
反渗透预处理必须能够去除原水中的绝大多数杂质，达到进水要求;反渗透预处理工艺必须能够高效、稳定的运行，同时尽量简化流程，降低投资和运行成本;反渗透预处理必须考虑水质的变化，防止原水水质波动时影响整个系统的稳定运行。